Gagasan yang sering diutarakan gusdur salah satunya tentang Pluralisme yang berkaitan dengan kemanusiaan.
Bagi Gusdur, Pluralisme yang dipahami sebagai keberagaman dan sikap saling menghormati merupakan keniscayaan yang sama sekali tidak boleh dipertentangkan, karena jika kita mempertentangkan keberagaman itu, maka sebenarnya kita sedang mempertentangkan Tuhan yang telah menciptakan keberagaman di bumi ini.